File Input Output Java

     * This value is always in the range 0
     * through count. If it is less
     * than count, then  buf[pos]
     * is the next byte to be supplied as input;
     * if it is equal to count, then
     * the  next read or skip
     * operation will require more bytes to be
     * read from the contained  input stream.
     *
     * @see     java.io.BufferedInputStream#buf
     */
    protected int pos;
    /**
     * The value of the pos field at the time the last 
     * mark method was called.
     * 

     * This value is always
     * in the range -1 through pos.
     * If there is no marked position in  the input
     * stream, this field is -1. If
     * there is a marked position in the input
     * stream,  then buf[markpos]
     * is the first byte to be supplied as input
     * after a reset operation. If
     * markpos is not -1,
     * then all bytes from positions buf[markpos]
     * through  buf[pos-1] must remain
     * in the buffer array (though they may be
     * moved to  another place in the buffer array,
     * with suitable adjustments to the values
     * of count,  pos,
     * and markpos); they may not
     * be discarded unless and until the difference
     * between pos and markpos
     * exceeds marklimit.
     *
     * @see     java.io.BufferedInputStream#mark(int)
     * @see     java.io.BufferedInputStream#pos
     */
    protected int markpos = -1;
    /**
     * The maximum read ahead allowed after a call to the 
     * mark method before subsequent calls to the 
     * reset method fail. 
     * Whenever the difference between pos
     * and markpos exceeds marklimit,
     * then the  mark may be dropped by setting
     * markpos to -1.
     *
     * @see     java.io.BufferedInputStream#mark(int)
     * @see     java.io.BufferedInputStream#reset()
     */
    protected int marklimit;
    /**
     * Check to make sure that underlying input stream has not been
     * nulled out due to close; if not return it;
     */
    private InputStream getInIfOpen() throws IOException {
        InputStream input = in;
        if(input == null)
            throw new IOException("Stream closed");
        return input;
    }
    /**
     * Check to make sure that buffer has not been nulled out due to
     * close; if not return it;
     */
    private byte[] getBufIfOpen() throws IOException {
        byte[] buffer = buf;
        if(buffer == null)
            throw new IOException("Stream closed");
        return buffer;
    }
    /**
     * Creates a BufferedInputStream
     * and saves its  argument, the input stream
     * in, for later use. An internal
     * buffer array is created and  stored in buf.
     *
     * @param   in   the underlying input stream.
     */
    public FastBufferedInputStream(InputStream in) {
        this(in, defaultBufferSize);
    }
    /**
     * Creates a BufferedInputStream
     * with the specified buffer size,
     * and saves its  argument, the input stream
     * in, for later use.  An internal
     * buffer array of length  size
     * is created and stored in buf.
     *
     * @param   in     the underlying input stream.
     * @param   size   the buffer size.
     * @exception IllegalArgumentException if size <= 0.
     */
    public FastBufferedInputStream(InputStream in, int size) {
        super(in);
        if(size <= 0) {
            throw new IllegalArgumentException("Buffer size <= 0");
        }
        buf = new byte[size];
    }
    /**
     * Fills the buffer with more data, taking into account
     * shuffling and other tricks for dealing with marks.
     * Assumes that it is being called by a synchronized method.
     * This method also assumes that all data has already been read in,
     * hence pos > count.
     */
    private void fill() throws IOException {
        byte[] buffer = getBufIfOpen();
        if(markpos < 0)
            pos = 0; /* no mark: throw away the buffer */
        else if(pos >= buffer.length) /* no room left in buffer */
            if(markpos > 0) { /* can throw away early part of the buffer */
                int sz = pos - markpos;
                System.arraycopy(buffer, markpos, buffer, 0, sz);
                pos = sz;
                markpos = 0;
            } else if(buffer.length >= marklimit) {
                markpos = -1; /* buffer got too big, invalidate mark */
                pos = 0; /* drop buffer contents */
            } else { /* grow buffer */
                int nsz = pos * 2;
                if(nsz > marklimit)
                    nsz = marklimit;
                byte nbuf[] = new byte[nsz];
                System.arraycopy(buffer, 0, nbuf, 0, pos);
                if(!bufUpdater.compareAndSet(this, buffer, nbuf)) {
                    // Can't replace buf if there was an async close.
                    // Note: This would need to be changed if fill()
                    // is ever made accessible to multiple threads.
                    // But for now, the only way CAS can fail is via close.
                    // assert buf == null;
                    throw new IOException("Stream closed");
                }
                buffer = nbuf;
            }
        count = pos;
        int n = getInIfOpen().read(buffer, pos, buffer.length - pos);
        if(n > 0)
            count = n + pos;
    }
    /**
     * See
     * the general contract of the read
     * method of InputStream.
     *
     * @return     the next byte of data, or -1 if the end of the
     *             stream is reached.
     * @exception  IOException  if this input stream has been closed by
     *        invoking its {@link #close()} method,
     *        or an I/O error occurs. 
     * @see        java.io.FilterInputStream#in
     */
    public int read() throws IOException {
        if(pos >= count) {
            fill();
            if(pos >= count)
                return -1;
        }
        return getBufIfOpen()[pos++] & 0xff;
    }
    /**
     * Read characters into a portion of an array, reading from the underlying
     * stream at most once if necessary.
     */
    private int read1(byte[] b, int off, int len) throws IOException {
        int avail = count - pos;
        if(avail <= 0) {
            /* If the requested length is at least as large as the buffer, and
               if there is no mark/reset activity, do not bother to copy the
               bytes into the local buffer.  In this way buffered streams will
               cascade harmlessly. */
            if(len >= getBufIfOpen().length && markpos < 0) {
                return getInIfOpen().read(b, off, len);
            }
            fill();
            avail = count - pos;
            if(avail <= 0)
                return -1;
        }
        int cnt = (avail < len) ? avail : len;
        System.arraycopy(getBufIfOpen(), pos, b, off, cnt);
        pos += cnt;
        return cnt;
    }
    /**
     * Reads bytes from this byte-input stream into the specified byte array,
     * starting at the given offset.
     *
     * 

 This method implements the general contract of the corresponding
     * {@link InputStream#read(byte[], int, int) read} method of
     * the {@link InputStream} class.  As an additional
     * convenience, it attempts to read as many bytes as possible by repeatedly
     * invoking the read method of the underlying stream.  This
     * iterated read continues until one of the following
     * conditions becomes true: 

     *
     *   
•  The specified number of bytes have been read,
       *
       *   
•  The read method of the underlying stream returns
       *   -1, indicating end-of-file, or
       *
       *   
•  The available method of the underlying stream
       *   returns zero, indicating that further input requests would block.
       *
       * 

 Subclasses of this class are encouraged, but not required, to
     * attempt to read as many bytes as possible in the same fashion.
     *
     * @param      b     destination buffer.
     * @param      off   offset at which to start storing bytes.
     * @param      len   maximum number of bytes to read.
     * @return     the number of bytes read, or -1 if the end of
     *             the stream has been reached.
     * @exception  IOException  if this input stream has been closed by
     *        invoking its {@link #close()} method,
     *        or an I/O error occurs. 
     */
    public int read(byte b[], int off, int len) throws IOException {
        getBufIfOpen(); // Check for closed stream
        if((off | len | (off + len) | (b.length - (off + len))) < 0) {
            throw new IndexOutOfBoundsException();
        } else if(len == 0) {
            return 0;
        }
        int n = 0;
        for(;;) {
            int nread = read1(b, off + n, len - n);
            if(nread <= 0)
                return (n == 0) ? nread : n;
            n += nread;
            if(n >= len)
                return n;
            // if not closed but no bytes available, return
            InputStream input = in;
            if(input != null && input.available() <= 0)
                return n;
        }
    }
    /**
     * See the general contract of the skip
     * method of InputStream.
     *
     * @exception  IOException  if the stream does not support seek,
     *        or if this input stream has been closed by
     *        invoking its {@link #close()} method, or an
     *        I/O error occurs.
     */
    public long skip(long n) throws IOException {
        getBufIfOpen(); // Check for closed stream
        if(n <= 0) {
            return 0;
        }
        long avail = count - pos;
        if(avail <= 0) {
            // If no mark position set then don't keep in buffer
            if(markpos < 0)
                return getInIfOpen().skip(n);
            // Fill in buffer to save bytes for reset
            fill();
            avail = count - pos;
            if(avail <= 0)
                return 0;
        }
        long skipped = (avail < n) ? avail : n;
        pos += skipped;
        return skipped;
    }
    /**
     * Returns an estimate of the number of bytes that can be read (or
     * skipped over) from this input stream without blocking by the next
     * invocation of a method for this input stream. The next invocation might be
     * the same thread or another thread.  A single read or skip of this
     * many bytes will not block, but may read or skip fewer bytes.
     * 

     * This method returns the sum of the number of bytes remaining to be read in
     * the buffer (count - pos) and the result of calling the
     * {@link java.io.FilterInputStream#in in}.available().
     *
     * @return     an estimate of the number of bytes that can be read (or skipped
     *             over) from this input stream without blocking.
     * @exception  IOException  if this input stream has been closed by
     *                          invoking its {@link #close()} method,
     *                          or an I/O error occurs.
     */
    public int available() throws IOException {
        return getInIfOpen().available() + (count - pos);
    }
    /** 
     * See the general contract of the mark
     * method of InputStream.
     *
     * @param   readlimit   the maximum limit of bytes that can be read before
     *                      the mark position becomes invalid.
     * @see     java.io.BufferedInputStream#reset()
     */
    public void mark(int readlimit) {
        marklimit = readlimit;
        markpos = pos;
    }
    /**
     * See the general contract of the reset
     * method of InputStream.
     *